儘管全氟辛酸會使人致癌的說法，目前尚未有定論，但卻有研究顯示可能會增加心臟疾病的風險。美國西維吉尼亞大學公共衛生學院尚卡爾（Anoop Shankar）博士在2012年9月的《內科醫學誌》（Archives of Internal Medicine）上所發表的研究報告，檢視了1999年到2003年參與「美國國家健康和營養調查」研究的1,216位40歲以上成人數據。 經過分析後，尚卡爾博士發現，在排除年齡、種族、性別、體重，以及參與者高血壓或糖尿病等因素下，血清中全氟辛酸濃度最高的族群，發生心血管疾病的機率，比血清中全氟辛酸濃度最低的人高出2倍，而罹患周邊動脈疾病的風險也高出78％，顯示血液中全氟辛酸的含量與罹患心臟疾病的程度有正相關。 美國德州理工大學衛生科學中心穆克吉（Debabrata Mukherjee）博士認為，雖然還需要更多前瞻性研究，才能證實全氟辛酸與心血管疾病之間的因果關係，但為了安全起見，建議盡量減少接觸含全氟辛酸的產品。
提高關節炎的發生機率
長期接觸含全氟辛酸的用品，也可能會增加關節炎的發生風險。美國西維吉尼亞大學醫學院的伊納斯（Kim E. Innes）博士在2011年6月的《美國流行病學期刊》（American Journal of Epidemiology）發表研究指出，21歲以上的民眾，如果血液中全氟辛酸的含量大於71.9奈克／毫升（ng/mL），將會提高42％罹患關節炎的機率。 由於在俄亥俄州和西維吉尼亞州曾有化工廠汙染當地的水源，伊納斯博士在6個民生用水被全氟辛酸和全氟辛烷磺酸汙染的地區，蒐集了49,432位、平均46.4歲居民的健康資料，並檢測他們血液中全氟辛酸和全氟辛烷磺酸的含量。 然後，再依血液中全氟辛酸的含量，將居民們分成4組，第一到第四組的含量分別為0.25～13.5奈克／毫升、13.6～28奈克／毫升、28.1～71.9奈克／毫升、72奈克／毫升以上。研究結果顯示，隨著血液中全氟辛酸的含量上升，關節炎的發生率也會跟著增加，和第一組相比，第二組到第四組分別會提高16％、21％、42％的風險。不過，研究中並未發現全氟辛烷磺酸會增加關節炎的發生機率。 此外，伊納斯博士也發現，年齡小於55歲的居民，若是血液全氟辛酸含量高（第四組），那麼發生關節炎的風險會比含量低（第一組）者高出53％的風險；而BMI低於30的居民，如果血液全氟辛酸含量高（第四組），發生關節炎的風險也會比含量低（第一組）者高出38％的風險。
導致孩童壞膽固醇升高
其實，用來製作不沾鍋和漢堡包裝紙的全氟辛酸，也可能會對兒童的健康產生危害。2010年9月，美國西維吉尼亞大學醫學院佛利斯比（Stephanie Frisbee）博士發表在《小兒及青少年醫學期刊》（Archives of Pediatric and Adolescent Medicine）的研究報告就指出，暴露在用來製作不沾鍋和防水布料的化學物質，可能導致兒童總膽固醇和俗稱「壞膽固醇」的低密度脂蛋白膽固醇（LDL）都比較高。 佛利斯比所領導的研究團隊，以美國俄亥俄州12,476名、年齡從1歲到18歲不等的兒童和青少年為樣本，研究他們血液中全氟辛酸和全氟辛烷磺酸含量對膽固醇的影響。這些孩童曾因俄亥俄河谷中部水源爆發全氟辛酸和全氟辛烷磺酸汙染事件，飲用汙染水至少1年以上。 雖然研究結果發現，血液中全氟辛酸含量超過全國平均值的兒童和青少年，總膽固醇和「壞」膽固醇均較高，但佛利斯比博士強調，這項發現並未證明全氟辛酸直接導致較高的膽固醇，只能顯示出兩者之間有關聯性，因此，有必要進行更多研究來釐清因果關係。
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